養殖行業畜禽舍內的有害氣體主要是氨和硫化氫。氨氣是來自地面糞尿、墊草和飼料等含氮有機物分解而成。當畜舍空氣中含量超過26ppm(百萬分之二十六)、禽舍超過20ppm后，可使畜禽呼吸道粘膜和眼結膜發炎，嚴重時可造成壞死性支氣管炎，肺水腫、出血、眼失明等，還可降低畜禽的生長速度和飼料的利用率。舍內空氣中的硫化氫是來自含硫有機物(糞尿、墊草和飼料等)的分解，當家畜家禽食高蛋白日糧和消化不良時，可產生并排出大量硫化氫。舍內空氣中硫化氫含量超過10ppm后，可剌激粘膜，引起眼淡，表現畏光、流淚，并可導致呼吸道炎癥、肺水腫，硫化氫在肺泡內被吸收進入血液后，可被氧化為無毒的硫酸鹽、硫代硫酸鹽、未被氧化的硫化氫剛產生有毒作用，它可與氧化型細胞色素氧化酶的三價鐵結合，影響細胞的氧化過程，造成組織缺氧。低濃度的硫化氫長期作用、可使畜禽慢性中毒、心動過緩、乏力、嘔吐、發生腸胃炎，并使其抗病力減弱；高濃度硫化氫是強烈的神經毒劑，可直接抑制呼吸中樞，造成動物窒息而亡。試驗和實踐都證明，硫化氫對畜禽的生長和生產也產生不良影響。

因此，對這類有害氣體不能任其自然，要主動預防，其具體預防措施如下：

一、合理設計：首先應從畜禽舍設計上考慮清類排尿系統的結構，從地面的材料、坡度和排水溝的布局到施工、操作都要便于污水、糞尿的順利排除，而不易在中途滯留。

二、注意通風：無論在任何季節、畜禽舍都應保持適量的通風，這是清除有害氣體的有效方法。不能因為冬季要保溫而緊閉門窗、這樣時間一久、會使舍內水汽和有害氣體大量蓄積、造成的危害可能超過所取得的保溫效果。

三、加強管理：1.及時清除糞尿。2.勤換墊草，對于厚墊草和其它不清糞或(高床雞舍)的畜禽舍、必須杜絕飲水器漏水，保持墊料的干燥。3.對于漏縫地板的畜舍必須配備季節供暖和通風設備，便于經常沖洗地板和糞溝，當濕度加大后、進行通風排濕，而后由供暖系統供給適宜的熱量、以保持適宜的舍溫。

四、對于高床不清糞式的畜舍還可在糞便上噴撒磷酸、每平方米0.4公斤，使糞堆的PH值低于7， 或手撒磷酸鹽、亞磷酸鹽、蛋雞按每只16克，肉雞每只10克撒過磷酸鈣，均可有效地減少氨氣的產生。

五、對畜禽舍內處上下，糞尿溝、糞池每周噴灑0.1%～0.2%的EM生物制劑1至2次，能清除糞尿的惡臭。這是目前上有效的除臭方法和防止有毒氣體傷害畜禽之法，因為EM生物制劑由5科10屬80多種微生物組成， 能吃掉形成惡臭物質的甲基硫醇和三甲胺。